商标转让协议是一种合同，用于将商标权利从一方转移给另一方。在商业交易中，商标转让协议有着重要的作用，主要体现在以下几个方面：

1.确保合法性

商标转让协议起到了确保商标交易的合法性的作用。根据法律规定，商标的转让必须通过书面协议完成，并办理商标权转移手续。商标转让协议中记载了双方在交易中的权利与义务，有助于确保交易的合法性，避免因转让过程中的各种疏漏而引起的纠纷。

2.规避法律风险

商标转让协议还能帮助转让方规避法律环节中的风险。商标转让协议中需要详细记载商标权的承继过程，包括旧商标权的注销，新商标权的申请与登记等，确保整个转让过程的合规性。同时，商标转让协议还需在协议中约定违约责任条款，对违反协议的一方进行严惩，降低双方违约的风险。

3.保证商标价值

商标作为企业的资产，具有很高的商业价值。商标转让协议能够从源头上保证商标价值，进而增加商标的交易成功率。商标转让协议能够明确商标的价值，约定相应的转让价格，同时还可以对商标的使用范围进行限制，以保证商标的品牌价值。

4.转移商业风险

商标转让协议能够将商标权的风险转移到另一方，起到了分散风险的作用。商标权的转移可能存在很多问题，例如商标侵权，商标冒用等，这些问题的出现可能会给商标持有人带来无法承受的损失。商标转让协议可以将商标权转移给另一方，降低商标持有人的风险。

商标转让协议是商标交易中不可或缺的一环。商标转让协议在确保合法性、规避法律风险、保证商标价值、转移商业风险等方面都发挥着重要的作用。因此，商标交易双方在进行商标转让时，应该重视商标转让协议，确保协议的合规性和完整性。